A Virológiai Nemzeti Laboratórium elsődleges kutatási területe az állatokról emberekre terjedő vírusok vizsgálata. A nemzeti laboratórium kötelékében jelenleg négy tematikus kutatócsoport elégíti ki a járványok korának és a globális pandémiás felkészülésnek teljeskörű vizsgálati igényeit. A kutatócsoport az alapkutatás mellett számos alkalmazott kutatási projektben is részt vesz, amelyek célja az orvosi, betegellátási gyakorlatban is alkalmazható tesztek, potenciálisan vírusellenes hatóanyagok fejlesztése, tesztelése, illetve változatos járványmegelőzési és járványvizsgálati technológiák kidolgozása és alkalmazása. A laboratórium kiemelt célja továbbá a magyarországi járványvédelmi kapcsolódású virológiai kutatások összefogása, melynek köszönhetően lehetővé válik modern technológiák folyamatos fejlesztésével és ezek alkalmazásával felvenni a versenyt a járványok megelőzésében, kivizsgálásában és elhárításában, illetve már ismert fertőző betegségek működésének jobb megismerésében.